在东京新宿的霓虹灯影下，年轻的数据分析师佐藤浩介意外接收到一串来源不明的加密信息。这串代码如同精准投放的鱼饵，将他引入一个名为“暗河”的跨国地下数据交易网络。起初，他以为这只是一次高额报酬的兼职解密，但当他破解出第一层信息，发现其中竟涉及一桩尘封多年的政治丑闻与金融黑幕时，他才惊觉自己已踏入无法回头的深渊。

影片以冷峻的都市谍战风格展开，浩介在看似偶然实则精心的安排下，接连遭遇身份不明的追踪与警告。他唯一能信任的，是偶遇的神秘女子绫濑，她声称自己是调查记者，手中握有能印证代码内容的证据。两人在东京的雨夜街巷、密集的数据机房与喧闹的街头咖啡馆之间穿梭，试图拼凑真相。然而，每一次接近核心，关键证据便会离奇消失或损毁，而绫濑的背景也愈发扑朔迷离。

情节的关键转折发生在一场精心策划的线上拍卖会。浩介发现，“暗河”交易的核心并非情报本身，而是一个能篡改现实档案、覆盖历史痕迹的底层算法——“完美覆盖”。这个发现让他不寒而栗：自己破解代码的行为，是否早已被计算在内，成为了整个“覆盖”计划的一环？信任与背叛在瞬间颠倒，身边的每个人都仿佛戴着双重面具。

影片在紧张的心理博弈与高速节奏的叙事中推进，营造出强烈的悬疑氛围。浩介必须在有限时间内分辨虚实，在数据洪流与真实威胁间找到那个能刺破黑暗的致命密钥。最终的选择，将不仅决定他自己的生死，更关乎一段被精心抹去的历史能否重见天日。